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PCR循環(huán)參數(shù)解析

日期:2024-09-06 17:17
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摘要: 循環(huán)參數(shù): 1.預變性 模板DNA完全變性與PCR酶的完全激活對PCR能否成功至關(guān)重要,建議加熱時間參考試劑說明書,一般未修飾的Taq酶激活時間為兩分鐘。 2.變性步驟 循環(huán)中一般95℃,30秒足以使各種靶DNA序列完全變性,可能的情況下可縮短該步驟時間。變性時間過長損害酶活性,過短靶序列變性不徹底,易造成擴增失敗。 3.引物退火 退火溫度需要從多方面去決定,一般根據(jù)引物的Tm值為參考,根據(jù)擴增的長度適當下調(diào)作為退火溫度。然后在此次實驗基礎上做出預估。退火溫度對PCR的特異性有較大...

循環(huán)參數(shù):

1.預變性

模板DNA完全變性與PCR酶的完全激活對PCR能否成功至關(guān)重要,建議加熱時間參考試劑說明書,一般未修飾的Taq酶激活時間為兩分鐘。

2.變性步驟

循環(huán)中一般95℃,30秒足以使各種靶DNA序列完全變性,可能的情況下可縮短該步驟時間。變性時間過長損害酶活性,過短靶序列變性不徹底,易造成擴增失敗。

3.引物退火

退火溫度需要從多方面去決定,一般根據(jù)引物的Tm值為參考,根據(jù)擴增的長度適當下調(diào)作為退火溫度。然后在此次實驗基礎上做出預估。退火溫度對PCR的特異性有較大影響。

4.引物延伸

引物延伸一般在72℃進行(Taq酶zui 適溫度)。但在擴增長度較短且退火溫度較高時,本步驟可省略延伸時間隨擴增片段長短而定,一般推薦在1000bp以上,含Pfu及其衍生物的衍生設定為1min/kbp。

5.循環(huán)數(shù)

大多數(shù)PCR含25-35循環(huán),過多易產(chǎn)生非特異擴增。

6.zui后延伸

在zui后一個循環(huán)后,反應在72℃維持10-30分鐘.使引物延伸完全,并使單鏈產(chǎn)物退火成雙鏈。